Las campañas de excavación de los yacimientos de la sierra de Atapuerca —que llevan realizándose de forma sistemática desde 1978— se desarrollan entre la segunda quincena de junio y finales del mes de julio. Durante ese periodo buena parte del equipo de gestión de la Fundación se dedica a la campaña y a la logística, comunicación, gestión de visitas especiales y organización de actos institucionales y de divulgación relacionados con las excavaciones y con las necesidades del EIA. Este equipo está integrado por cerca de 300 profesionales, en su mayoría doctores y licenciados en disciplinas relacionadas con la evolución humana.
La Fundación dota al EIA de los materiales, equipos y servicios necesarios para las labores de excavación e investigación en la sierra de Atapuerca, complementando la ayuda pública que facilita la Junta de Castilla y León, de quien dependen las excavaciones.
Gracias a los patronos y colaboradores de la Fundación que prestan su apoyo de forma especial en esta época, las excavaciones se desarrollan con la máxima efectividad.